本项目拟解决的三个关键科学问题：

1. 建立和设计绿色环保的秸秆预处理方法和配套发酵设备，为秸秆大规模资源化利用提供可靠和便利的基础条件。

2. 以不同秸秆资源为基础，筛选差异化高效酶生产菌株。并在此基础上，对相关菌株进行基因工程和蛋白质工程改造，增加酶表达水平和稳定性，降低酶的使用成本，是秸秆高效转化的重要前提条件。

3. 筛选高效安全的高产蛋白的酵母菌株。